16 août 2012

Prevalence of SHANK3 variants in patients with different subtypes of autism spectrum disorders

Traduction: G.M. 

Prévalence de variants de SHANK3 chez les patients atteints de différents sous-types de troubles du spectre autistique 

Boccuto L , M Lauri , Sarasua SM , CD Skinner , Buccella D , A Dwivedi , Orteschi D , JS Collins , Zollino M , P Visconti , Dupont B , D Tiziano , Schroer RJ , Neri G , Stevenson RE , Gurrieri F , Schwartz CE . 

Source

1] Greenwood Genetic Center, Greenwood, Caroline du Sud, États-Unis [2] Istituto di Genetica Medica, Università Cattolica del S. Cuore, Rome, Italie. 

Résumé

Les troubles du spectre autistique (TSA) comprennent trois conditions principales: le trouble autistique (TA), trouble envahissant du développement non spécifiées par ailleurs (TED-NS), et le syndrome d'Asperger (SA).
Il a été démontré que de nombreux gènes associés aux TSA sont impliqués dans l'interaction neuroligine-neurexine au niveau de la synapse glutamate: NLGN3, NLGN4, NRXN1, CNTNAP2 et SHANK3. 
Nous avons examiné ce dernier gène dans deux cohortes de patients TSA (133 patients de 88 à partir de États-Unis et Italie). 
Nous avons trouvé 5/221 (2,3%) à des altérations pathogènes: une délétion 106 kb couvrant le gène SHANK3, deux mutations de changement conduisant à des codons d'arrêt prématuré, une mutation faux-sens (p.Pro141Ala), et une mutation d'épissage (c.1820- 4 G> A). 
En outre, chez 17 patients (7,7%), nous avons détecté une transition c.1304 48 C> T affectant une cytosine méthylée dans un îlot CpG. (?)
Cette variante est signalée comme SNP rs76224556 et a été trouvé à a fois dans le groupe contrôle américains et italiens, mais de façon significativement plus fréquente dans nos cas que dans les cohortes de contrôle. 
La variante est également significativement plus fréquente en cas de PDD-NOS que dans les cas de MA. Nous avons également projeté ce gène dans une cohorte de réplication indépendante de 104 patients américains atteints de TSA, dans laquelle nous avons trouvé une mutation faux-sens (p.Ala1468Ser) chez 1 patient (0,9%), et une le c. 1304 48 C> T transition chez 8 patients (7,7%).
Alors que les variants de SHANK3 sont présentes dans tout sous-type TSA, le SNP rs76224556 semble être significativement associé à la PDD-NOS. 

Cela représente la première preuve d'une corrélation génotype-phénotype dans les TSA et souligne l'importance d'une évaluation clinique neuropsychiatrique détaillée pour le dépistage génétique efficace des patients avec TSA .

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