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31 décembre 2012

Study finds no link between autism and gut microbes

Traduction : J.V.

Une étude ne révèle aucun lien entre l'autisme et les microbes intestinaux


Emily Anthes - 5 novembre 2012 

Controverse bactérienne

Certaines études ont trouvé certaines espèces bactériennes chez les enfants atteints d'autisme et non chez les témoins, mais une nouvelle étude affirme qu'il n'y a aucune différence entre les groupes. Contredisant une hypothèse populaire dans l'autisme, une nouvelle étude d'Australie n’a trouvé aucun lien entre l'autisme et les bactéries dans l'intestin. 


L'analyse, publiée le 20 Septembre dans la revue « Autism Research », rapporte que les systèmes gastro-intestinaux (GI) des enfants atteints d'autisme comportent les mêmes bactéries que celles développées typiquement dans leur fratrie 1. "Notre conclusion était qu’il n'y a aucun organisme que l'on peut identifier comme étant toujours impliqué dans l'autisme», explique Enzo Palombo, professeur agrégé de microbiologie à l'Université de Technologie de Swinburne à Melbourne, en Australie, qui est l'un des chercheurs. 
Basé sur 51 enfants atteints d'autisme et 53 frères et sœurs, l'étude est plus grande que la plupart des études sur le microbiome - la collecte des microbes dans le corps - chez les enfants atteints d'autisme. 
Comme les frères et sœurs partagent gènes et leur environnement, cette approche permet de réduire le «bruit» dans les données des facteurs non liés à l'autisme, selon les chercheurs. Cependant, des critiques soutiennent que parce que les enfants d'une même famille ont tendance à avoir des microbiomes similaires, comparer les enfants qui souffrent d'autisme avec leurs frères et sœurs non atteints peut également rendre plus difficile de repérer des anomalies subtiles associées à l'autisme. 
Pendant des années, les scientifiques ont soupçonné que quelque chose n’allait pas dans les intestins d'enfants atteints d'autisme. 
Plusieurs études ont montré, par exemple, que ces enfants souffrent de problèmes gastro-intestinaux à des taux beaucoup plus élevés que les autres enfants 2 3 4.
L'analyse des bactéries intestinales chez les enfants atteints de la maladie a révélé quelques conclusions provocantes. Par exemple, une étude réalisée en 2005 a révélé que les enfants sur le spectre de l'autisme ont des niveaux élevés de Clostridia, une classe de bactéries qui peuvent produire des neurotoxines, dans leurs intestins 5. 
Et dans une étude de cette année, les chercheurs ont constaté une classe de bactéries appelées Sutterella chez les enfants qui ont à la fois l'autisme et des troubles gastro-intestinaux, mais pas dans des contrôles avec un développement normal. 
Certains chercheurs sont même allés jusqu'à suggérer que ces populations microbiennes atypiques peuvent activement contribuer aux symptômes de l'autisme. 
Par exemple, la recherche a montré l'année dernière que les acides gras produits par les bactéries intestinales peuvent altérer le cerveau et le comportement 6 7. 

Lien obscur

C'est une proposition controversée, en particulier parce que le lien entre l'autisme et les microbes intestinaux reste trouble. Jusqu'à présent, les études ont été faibles et leurs résultats contradictoires, impliquant différents types de bactéries. 
Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont séquencé l'ADN extrait à partir des selles de 51 enfants atteints d'autisme et de 53 de leurs frères et sœurs non atteints, tous âgés entre 2 et 12. Les chercheurs ont alors comparé les séquences contre une base de données de génomes bactériens pour identifier les microbes dans chaque échantillon. 
Il n'y a pas de différences significatives dans les types de bactéries ou leurs niveaux entre les enfants autistes et leurs frères et sœurs qui se développent normalement, selon les chercheurs. Ils n'ont pas trouvé de différences entre les microbes intestinaux des enfants autistes qui ont des symptômes gastro-intestinaux et ceux qui n'en ont pas, ou entre les enfants atteints de formes sévères de l'autisme et ceux qui ont des formes légères de la maladie. "Nous montrons que le lien entre les bactéries spécifiques dans l'intestin et les symptômes autistiques et le comportement n'est pas défini», explique Palombo. 
Cependant, d'autres chercheurs disent que c'est trop tôt pour rejeter l'idée que les bactéries intestinales jouent un rôle dans l'autisme. «En général, je pense que c'est une étude bien gérée», explique Sydney Finegold, professeur émérite de médecine à l'Université de Californie, Los Angeles. 
Finegold complimente les chercheurs australiens, en particulier, pour leur échantillon de grande taille, et pour avoir inclus à la fois les enfants avec et sans problèmes gastro-intestinaux. Mais, il ajoute: «Je suis en désaccord avec la conclusion selon laquelle il n'y a pas de relation entre les bactéries intestinales et la dysfonction gastro-intestinale et l'autisme." 
D'une part, selon Finegold, les résultats de l'étude peuvent être faussées par l'utilisation d'antibiotiques. Palombo et ses collègues ont exclu des enfants de leur étude lorsqu’ils avaient pris des antibiotiques au cours des 15 jours précédents, mais Finegold dit qu'il croit que ce critère n'est pas suffisamment rigoureux. «Nous savons que l'impact des antibiotiques sur les bactéries intestinales dure pendant des mois, et certains diraient des années», dit-il. Il dit que ces études devraient de préférence exclure les enfants qui ont pris des antibiotiques à tout moment au cours des mois précédents. 
Pour sa part, Palombo dit: «Je suis d'accord qu'une période plus longue d’abstinence aurait été idéale, mais nous ne pouvions pas avoir eu d’assez nombreux participants pour l'étude." 

Des différences subtiles

Palombo convient qu'il est trop tôt pour se prononcer sur un lien entre les bactéries intestinales et l'autisme. Une poignée d'enfants atteints d'autisme ont diverses anomalies bactériennes, telles que un niveau élevé d'une espèce ou d'une autre, dit-il, indiquant qu'un sous-ensemble des enfants atteints de la maladie peuvent présenter des différences. 
Certains experts affirment qu’en comparant des microbes intestinaux des enfants autistes avec ceux de leurs frères et sœurs non atteints, plutôt que des contrôles indépendants, il peut être plus difficile de détecter des différences subtiles. 
"L'autisme est une étiologie complexe», explique Catherine Lozupone, une stagiaire postdoctorale dans le laboratoire de Rob Knight de l'Université du Colorado à Boulder. «Il y a une base génétique pour lui et il y a une base environnementale pour lui." 
Frères et sœurs partagent de nombreux gènes et expositions environnementales, on peut s'attendre à avoir des microbiomes similaires. En fait, certaines recherches ont montré que, tandis que les microbes intestinaux des enfants autistes sont très différents de ceux des contrôles indépendants, frères et sœurs ont des populations microbiennes qui se situent dans la moyenne 5 8. 
Prochains plans de l'équipe australienne pour chercher des différences dans les populations virales parmi ces groupes, ainsi que pour étudier si les bactéries chez les enfants autistes produisent des métabolites différents de ceux des enfants qui se développent normalement.

Dans l'ensemble, les résultats contradictoires de ces études pourraient résulter du fait qu'il n'y a pas encore d'une manière standard unique pour mener cette recherche, dit Lozupone. En plus d'utiliser différents types de populations témoins, les chercheurs peuvent recueillir l'ADN microbien à partir d'échantillons fécaux ou, occasionnellement, directement d’une biopsie de l'intestin. 
Certains scientifiques comparent la présence de certaines espèces ou de genres, et d'autres recherchent des différences dans les familles ou catégories de bactéries, qui peuvent masquer des différences subtiles à la plus fine, du niveau de l'espèce. 
"Il est vraiment difficile d'interpréter les résultats du microbiome», dit Lozupone. «C'est un nouveau domaine - nous en sommes encore à essayer de comprendre comment analyser les données."



1: Gondalia S.V. et al. Autism Res. Epub ahead of print (2012) PubMed

2: Valicenti-McDermott M. et al. J. Dev. Behav. Pediatr. 27, S128-S136 (2006) PubMed
3: Gilger M.A. and C.A. Redel Pediatrics 124, 796-798 (2009) PubMed
4: Horvath K. and J.A. Perman Curr. Opin. Pediatr. 14, 583-587 (2002) PubMed
5: Parracho H.M. et al. J. Med. Microbiol. 54, 987-991 (2005) PubMed
6: MacFabe D.F. et al. Behav. Brain Res. 176, 149-169 (2007) PubMed
7: Shultz S.R. et al. Neuropharmacology 54, 901-911 (2008) PubMed
8: Finegold S.M. et al. Anaerobe 16, 444-453 (2010) PubMed


Commentaires :Cet article complète deux articles publiés sur AIS (mais le mot-clé est différent : Sutterella et bactérie).


Il y a plusieurs commentaires sur le site de la SFARI, disant que le titre de l'article est trompeur, dans la mesure où l'article est plus nuancé, et qu'il renvoie aussi aux articles sur Sutterella. 
D'autre part, un spécialiste du sujet, Paul H Patterson, écrit le 16/11 :
I also find the title of this piece misleading. In Fig. 4 of the article, one finds that there are indeed differences in the microbial content of the ASD samples. These are apparently the less abundant species and so they do not contribute much to the overall "weighted" analysis. However, we all know that even a single species can give us great GI discomfort on occasion!
Another point is that prior studies did not agree on the same species as being different in ASD. This could be due to the fact that these several studies did not use the same experimental methods of sample collection and data analysis.
Traduction : "Je trouve aussi le titre trompeur. Dans la Fig. 4 de l'article [publié par Autism Research], on trouve qu'il y a effectivement des différences dans la teneur microbienne des échantillons de TSA. Ce sont apparemment les espèces moins abondantes et donc elles ne contribuent pas beaucoup à l'analyse globale «pondérée» . Cependant, nous savons tous que même une seule espèce peut nous donner un grand inconfort gastro-intestinal, à l'occasion!
Un autre point est que les études antérieures ne sont pas d'accord sur les mêmes espèces comme étant différentes dans les TSA. Cela pourrait être dû au fait que ces études différentes n'ont pas utilisé les mêmes méthodes expérimentales de prélèvement d'échantillons et d'analyse des données."

26 novembre 2011

The potential role of probiotics in the management of childhood autism spectrum disorders

Traduction: G.M.

Le rôle potentiel des probiotiques dans la gestion des troubles du spectre autistique chez l'enfant.
Critchfield JW, van Hemert S, M Ash, Mulder L, Ashwood P.
source

Département de microbiologie médicale et l'immunologie, Université de Californie, Davis, CA 95616, États-Unis.

Résumé

Le dysfonctionnement Gastro-intestinal (GI) a été signalé chez un nombre important d'enfants ayant des troubles du spectre autistique (TSA). L'activation de la réponse immunitaire muqueuse et la présence anormale du microbiote intestinal sont maintes fois observés chez ces enfants. Chez les enfants atteints de TSA, la présence d'un dysfonctionnement gastro-intestinal est souvent associée à une irritabilité accrue, des crises de colère, des comportements agressifs et des troubles du sommeil. Par ailleurs, un traitement antibiotique modulant à court terme les bactéries intestinales peut conduire à une amélioration temporaire des symptômes comportementaux chez certains individus atteints de TSA. Les probiotiques peuvent influencer la composition du microbiote et la fonction de la barrière intestinale et modifier la réponse immunitaire de la muqueuse.
L'administration de bactéries probiotiques pour traiter des changements dans le microbiote pourrait donc être un nouvel outil thérapeutique utile pour restaurer la flore intestinale normale, réduire l'inflammation, restaurer la fonction de la barrière épithéliale, et potentiellement améliorer les symptômes comportementaux associés à certains enfants atteints de TSA.
Dans cette revue de la littérature, le soutien se dégage pour des essais cliniques des probiotiques dans les TSA, en particulier dans le contexte du traitement des symptômes gastro-intestinaux.

03 octobre 2011

Impaired Carbohydrate Digestion and Transport and Mucosal Dysbiosis in the Intestines of Children with Autism and Gastrointestinal Disturbances

Traduction : J.V.

Facultés affaiblies de digestion et de transport des glucides et dysbiose muqueuse dans les intestins des enfants autistes et troubles gastro-intestinaux

Brent L. Williams1, Mady Hornig1, Timothy Buie2, Margaret L. Bauman3, Myunghee Cho Paik4, Ivan Wick1, Ashlee Bennett1, Omar Jabado1, David L. Hirschberg1, W. Ian Lipkin1*

1 Center for Infection and Immunity, Columbia University, New York, New York, United States of America, 2 Division of Pediatric Gastroenterology and Nutrition, Massachusetts General Hospital, Boston, Massachusetts, United States of America, 3 Department of Neurology, Harvard Medical School and Departments of Neurology and Pediatrics and Learning and Developmental Disabilities Evaluation and Rehabilitation Services (LADDERS), Massachusetts General Hospital, Boston, Massachusetts, United States of America, 4 Department of Biostatistics, Columbia University, Mailman School of Public Health, New York, New York, United States of America


Les troubles digestifs sont fréquemment rapportés chez les enfants atteints d'autisme, compliquent la gestion clinique, et peuvent contribuer à de troubles de comportement. Des compte-rendus de déficiences dans l'activité enzymatique disaccharidase et des réponses bénéfiques aux thérapies probiotiques et de régime nous ont conduit à examiner l’expression des gènes et le microbiote mucoepithelial dans les biopsies intestinales chez des enfants atteints d'autisme et de maladies gastro-intestinales et des enfants avec des maladies gastro-intestinales seules. Les transcriptions iléales encodant la disaccharidase et les transporteurs d'hexoses étaient déficients chez les enfants autistes, indiquant une insuffisance de la voie principale pour la digestion et le transport des glucides dans les entérocytes. L'expression déficiente de ces enzymes et des transporteurs a été associée à l'expression du facteur de transcription intestinale, CDX2. Une analyse métagénomique des bactéries intestinales a révélé une dysbiose de composition manifeste telle que des diminutions de Bacteroidetes, l'augmentation du ratio de Firmicutes par rapport aux Bacteroidetes, et des augmentations de Betaproteobacteria. Des niveaux d'expression des disaccharidases et des transporteurs ont été associées à l'abondance de phylotypes bactériens concernés. Ces résultats indiquent une relation entre l'expression de gènes humains de l’intestin et la structure du milieu bactérien et peut fournir des indications sur la physiopathologie des troubles gastro-intestinaux chez les enfants autistes.*


Article complet en anglais

New Insight into Autism and Intestinal Problems

Traduction : J.V.

Un nouvel éclairage sur l'autisme et des problèmes intestinaux

Comme des parents l’ont depuis longtemps signalé, de nombreux enfants autistes ont l’expérience de problèmes graves gastro-intestinaux (GI) et l'inconfort qui y est associé peut aggraver les comportements. Des chercheurs, à leur tour, ont trouvé un lien fort entre les symptômes gasto-intestinaux (GI) et la sévérité de l'autisme. Certains experts ont même proposé que les toxines produites par les bactéries intestinales anormales peuvent déclencher ou aggraver l'autisme chez certains enfants.

Aujourd’hui, des scientifiques à Columbia et Harvard indiquent que l'activité GI des enfants autistes diffère de celle des autres enfants de deux manières principales :

1) Leurs cellules intestinales montrent des anomalies dans la façon dont elles se décomposent [détériorent ?] et transportent des glucides, et

2) Leurs intestins abritent des quantités anormales de certaines bactéries digestives. (Les bactéries jouent un rôle important dans la digestion normale. Mais des niveaux anormaux de certaines bactéries ont été associés à des problèmes digestifs et d'inflammation intestinale.)

Les deux résultats sont probablement liés, suggèrent les chercheurs. Des altérations dans la façon dont les cellules intestinales décomposent les glucides peuvent affecter la quantité et le type de nutriments que ces cellules fournissent aux bactéries intestinales. Ceci, à son tour, peut modifier la composition du milieu intestinal normal de bactéries digestives – des maladies en résultant

"Ces résultats sont cohérents avec d'autres recherches suggérant que l'autisme peut être un trouble de l’ensemble du système, explique un co-auteur Mady Hornig, MD, directeur de la Recherche translationnelle [ ?] au Centre de l'Université de Columbia pour les maladies infectieuses et immunitaires. L'étude est disponible en ligne à travers la revue scientifique PLOS-One.

Ces résultats peuvent aussi expliquer pourquoi de nombreux parents d'enfants avec autisme signalent que des régimes spéciaux et des probiotiques (suppléments alimentaires contenant des "bonnes" bactéries) améliorent non seulement la digestion de leurs enfants mais aussi leur comportement, notent les chercheurs. Toutefois, ils rappellent qu'une étude plus approfondie est nécessaire car leurs conclusions étaient basées sur des échantillons de tissus à partir d'un nombre relativement faible d'enfants (une quinzaine avec autisme et sept au développement typique).

Autism Speaks a co-financé l'étude avec le National Institutes of Health, Google.org et le ministère de la Défense. Reconnaissant que les problèmes gastro-intestinaux touchent de nombreux enfants et adolescents atteints d'autisme, Autism Speaks a récemment accordé un important Prix du Pionnier à Suzanne et Bob Wright pour la recherche sur les mécanismes biologiques de troubles gastro-intestinaux dans les TSA. La recherche comprendra des essais cliniques d'une nouvelle thérapie probiotique qui a montré des résultats prometteurs dans le rétablissement de la fonction gastro-intestinale.

"Les problèmes gastro-intestinaux sont une préoccupation commune et pénible pour de nombreux enfants et adolescents atteints de TSA et leurs familles», explique la directrice scientifique d’Autism Speaks, Geraldine Dawson, Ph.D. «Ces conditions ne sont pas seulement une contrainte sur la santé des enfants touchés, les problèmes gastro-intestinaux peuvent sérieusement nuire à leur capacité à participer et à bénéficier des activités de la vie quotidienne, de l'éducation et des activités thérapeutiques ? »